Sankt Johannes kloster (eller Sankt Johannes teologens kloster) är ett grekiskt kloster grundat år 1088 i Chora på ön Patmos. Klostret blev tillsammans med Apokalypsgrottan på ön ett världsarv 1999. Det är byggt på platser där såväl Romersk-katolska kyrkan och Ortodoxa kyrkan anser vara platsen där Sankt Johannes tog emot sina uppenbarelser som är nedtecknade i Uppenbarelseboken.
År 1088, gav den bysantinske kejsaren Alexios I Komnenos ön Patmos till soldatprästen John Christodoulos. Större delen av klostret var färdigställt tre år senare. Han befäste exteriören på grund av hot från pirater och seldjuker.
